Acquiring Microscopic Images of Very High Resolution by a Method ofComposing
Pořizování obrazů o velmi vysokém rozlišenímetodou skládání
Při získávání mikroskopických obrazů o velmi vysokém rozlišení metodou skladu výslednéhoobrazu z jednotlivých dílů jsme narazili na některé problémy. Mezi nimi byla nutnost refokusacemezi jednotlivými dílky. S tím souvisely problémy se spojením obrazů, které si vzájemně zcelaneodpovídaly a oblast spojení byla zřetelná. Byl vyvinut program překonávající některé problémypři spojování obrazových dílků, který pracuje se všemi díly naráz a hledá optimální pořadí spojenídílů. Jednotlivé dílky spojuje strmým gradientem, který probíhá po náhodně generované křivce.Program dává dobré výsledky i při spojení obrazů s pozadím či otvory ve snímané tkáni.Metoda postupného snímání a následné montáže obrazu byla využita i pro snímání sbírky kožníchlymfomů ve spolupráci s Institutem pro dermatologii Univerzitní nemocnice v Curychu. Taktovzniklá digitální sbírka je veřejně k dispozici jako kapitola šesté verze Hypertextového atlasudermatopatologie na www.muni.cz/atlases.
Klíčová slova:
digitální mikrofotografie - počítačová analýza obrazu - interaktivní atlas - dermatopatologie- hypertext
Authors:
J. Feit 1; V. Ulman, KempfW. 2 3; H. Jedličková 4
Authors‘ workplace:
Patologicko-anatomický ústav FN Brno 2Fakulta informatiky, Masarykova Univerzita, Brno 3Institut Dermatologie, Univerzitní nemocnice, Curych 4Dermatovenerologická klinika, FN U Sv. Anny, Brno
1
Published in:
Čes.-slov. Patol., , 2004, No. 2, p. 78-82
Category:
Overview
Composing microscopic images of very high resolution from several parts posed some problems.One of them was the necessity to adjust the focusing level when moving from one part to another.Re-focusing lead to problems with joining the image parts, which did not correspond exactly, andthe area of image fusion was noticeable. A computer program was developed to overcome theseproblems. Our program worked with all the image parts together to find their optimal order forimage fusion. Individual image parts were joined using a steep gradient running along a randomlygenerated curve. This method gave good results even in images with background or holes in thetissue. The method of composing large images from individual parts was used for digitizing theskin lymphoma collection of the Institute of Dermatology, University Hospital, Zürich. This collectionof digital images is a part of the 6th version of Hypertext atlas of Dermatopathology atwww.muni.cz/atlases.
Key words:
digital microphotography - image analysis - interactive atlas - dermatopathology -hypertext
Labels
Anatomical pathology Forensic medical examiner ToxicologyArticle was published in
Czecho-Slovak Pathology
2004 Issue 2
Most read in this issue
- Paraneoplastic Opsoclonus-MyoclonusSyndrome Associated with Malignant FibrousHistiocytoma: Neuropathological Findings
- Assessment of Proliferative Activity of Plasma Cells in Multiple Myeloma
- A Unique Case of Congenital Muscular Dystrophy
- Immunohistochemical Study of MelanocyticDifferentiation Antigens in CutaneousMalignant MelanomaA Comparison of Six Commercial Antibodiesand One Non-commercial Antibody in NodularMelanoma, Superficially Spreading Melanomaand Lentigo Maligna Mel anoma